عملکرد اصلی درهای اتاق تمیز، ایجاد یک مانع موثر برای جلوگیری از ورود آلودگی‌ها و ذرات معلق به داخل اتاق تمیز است. این درها با درزگیری قوی و طراحی ویژه، جلوی هرگونه نفوذ گرد و غبار، میکروب‌ها و ذرات معلق را می‌گیرند و فشار هوای داخل اتاق را نیز حفظ می‌کنند. برخی از درهای اتاق تمیز به سیستم‌های کنترل فشار مجهز هستند که با باز و بسته شدن درب، فشار داخل و بیرون اتاق تمیز را تنظیم می‌کنند.

• درهای کشویی اتاق تمیز: این درها به صورت افقی باز و بسته می‌شوند و معمولاً برای فضاهایی که نیاز به باز و بسته شدن سریع و آسان دارند، مناسب‌اند. درهای کشویی فضای کمی اشغال می‌کنند و به دلیل طراحی خاص، مانع ورود آلودگی و ذرات معلق می‌شوند.
• درهای لولایی اتاق تمیز: این درها همانند درهای معمولی باز و بسته می‌شوند اما با درزگیرهای مخصوص که مانع ورود و خروج آلودگی می‌شوند. این نوع درب‌ها معمولاً در فضاهایی استفاده می‌شوند که نیاز به باز و بسته شدن آرام و دقیق دارند.
• درهای اتوماتیک: این درها به سنسورهای حرکتی مجهز هستند و بدون نیاز به تماس فیزیکی باز و بسته می‌شوند. درهای اتوماتیک اتاق تمیز معمولاً در ورودی‌ها و خروجی‌هایی که نیاز به تردد بالا دارند، استفاده می‌شوند و خطر انتقال آلودگی را کاهش می‌دهند.
• درهای ضد آتش اتاق تمیز: برخی از درهای اتاق تمیز دارای ویژگی‌های ضد آتش هستند و برای محیط‌هایی که نیاز به مقاومت در برابر حریق دارند، مناسب‌اند. این درها معمولاً دارای گواهینامه‌های ضد حریق و ایمنی آتش‌سوزی هستند.
• درهای هرمتیک اتاق تمیز: این درها با مکانیزم درزگیری قوی و بدون شکاف طراحی شده‌اند و برای اتاق‌هایی که نیاز به شرایط فوق‌العاده استریل دارند، مناسب‌اند. درب‌های هرمتیک، در هنگام بسته شدن به‌طور کامل درزگیری می‌شوند و از هرگونه جریان هوا و ورود آلودگی جلوگیری می‌کنند.